Kafukufuku waposachedwapa wofalitsidwa muMicrobiomeadachita kusanthula kwa ma virus metagenomic pa nyama zazing'ono 846 zakuthengo—kuphatikizapo mileme, makoswe, ndi shrews—zomwe zinasonkhanitsidwa ku Sierra Leone, West Africa. Kafukufukuyu adapeza ma RNA virus okwana 39 okhudzana ndi nyama, kuphatikizapo ma virus atsopano 26 ndi 13 omwe ankadziwika kale. Pakati pa awa, banja la Paramyxoviridae linawonetsa kusiyanasiyana kwakukulu, pomwe makoswe anali ndi mitundu yambiri ya ma virus (n = 26).
Kuwunika zoopsa za matenda a zoonotic kunavumbula mavairasi atatu odziwika bwino a matenda a zoonotic—kachilombo ka encephalomyocarditis, kachilombo ka Lassa, ndi Rocahepevirus sp—komanso mavairasi atatu omwe angakhale ndi chiopsezo chofalikira: Kachilombo ka Melian, kachilombo ka hepatitis ya makoswe, ndi kachilombo ka Hunnivirus A. Chodziwika bwino n'chakuti, pakati pa mavairasi atsopano omwe apezeka, Bat ledantevirus 2 inasonyeza ubale wapafupi kwambiri ndi kachilombo ka Le Dantec komwe kamayambitsa matenda kwa anthu. Kusanthula kwa serological kunapezanso kuti ma antibodies oletsa kachilomboka afalikira mwa 2.8% mwa anthu okhala m'deralo, zomwe zikusonyeza kuti anthu adakumanapo kale, mwina osapezeka.
Zomwe zapezekazi zikuwonetsa kupezeka kwa malo osungira mavairasi ambiri ku West Africa ndipo zikugogomezera kufunika kwakukulu kwa njira zowunikira pamodzi pakati pa anthu ndi nyama. Kuphatikiza kuyesa kwa metagenomic ndi kutsimikizira kwa serological kumapereka njira yolimba yodziwira mavairasi omwe ali ndi zoonotic ndi omwe amatha kutuluka.
M'zaka khumi zapitazi, matenda opatsirana opitilira 60% mwa anthu amachokera m'malo osungira nyama, ndipo mileme, makoswe, ndi shrews amadziwika kuti ndi malo ofunikira kwambiri a mavairasi a zoonotic. Africa imaonedwa kwambiri ngati malo odziwika bwino a matenda a zoonotic. Mwachitsanzo, Sierra Leone idanena za milandu yopitilira 28,000 panthawi ya mliri wa Ebola wa 2014-2016.
Ngakhale kuti matenda a zoonotic ali ndi vuto lalikulu m'derali, kusiyanasiyana ndi kufalikira kwa mavairasi m'zinyama zazing'ono zakuthengo sikunadziwike mokwanira. Pofuna kuthetsa kusiyana kumeneku, ofufuza adachita kafukufuku wokhazikika wa zinyama zazing'ono zakuthengo 846 zomwe zidagwidwa m'malo atatu ku Sierra Leone pakati pa 2018 ndi 2023. Kafukufukuyu cholinga chake chinali kuwonetsa kusiyanasiyana kwa mavairasi, kuzindikira omwe ali ndi mwayi wofalitsa matenda osiyanasiyana, kuwunika chiopsezo cha zoonotic, ndikupanga umboni wothandizira machitidwe ochenjeza matenda opatsirana omwe akubwera.
Njira Zapakati
Kafukufukuyu adagwiritsa ntchito njira yonse yogwiritsira ntchito ma virus metagenomics:
- Kukonza zitsanzo:Minofu ya mtima, chiwindi, ndulu, mapapo, ndi impso zinasonkhanitsidwa, kuyikidwa pamodzi, ndikuyikidwa mu RNA yonse.
- Kutsata ndi kusonkhanitsa:Kuchepa kwa ribosomal RNA kunachitika lisanamangidwe laibulale, kutsatiridwa ndi kutsata kwapamwamba pogwiritsa ntchito nsanja ya Illumina NovaSeq 6000. Ma virus contigs adasonkhanitsidwa de novo.
- Kuzindikira kachilombo:Mavairasi adapezeka potengera RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) gene alignment. Mavairasi okhawo omwe ali ndi vertebrate-associated ndi omwe adasungidwa, kupatula mabakiteriya, bowa, ndi ma plant virus.
- Kusanthula kwa Bioinformatics:Kukonzanso kwa majini, kusanthula kwa recombination, kupanga chitsanzo cha netiweki yotumizira mitundu yosiyanasiyana, ndi kuwunika zoopsa za zoonotic kunachitika.
- Kutsimikizika kwa serological:Kuyesa kwa VSV-based pseudovirus neutralization assay kunapangidwa kwa Bat ledantevirus 2. Ma antibodies oletsa kufalikira kwa kachilomboka adapezeka mu 2.8% ya matenda a anthu, zomwe zinapereka umboni wakuti kachilomboka kangathe kufalikira ku zoonotic.
PhunziroZotsatira
1. Kupeza Mavairasi ndi Kusiyanasiyana
Kafukufukuyu adapanga kusanthula kwa transcriptomic sequencing pa nyama zakuthengo 846 zomwe zinasonkhanitsidwa ku Sierra Leone, kuphatikizapo makoswe, mileme, ndi shrews. Kutengera ma gene onse a RNA polymerase (RdRp) omwe amadalira RNA, ma virus 39 a RNA okhudzana ndi nyama adapezeka, kuphatikizapo ma virus 13 omwe ankadziwika kale ndi ma virus atsopano 26.
Ponena za kapangidwe ka mavairasi, banja la Paramyxoviridae linasonyeza kuchuluka kwa mitundu yosiyanasiyana ya mavairasi m'magulu onse atatu, kutsatiridwa ndi Astroviridae ndi Picornaviridae. Ponena za kufalikira kwa mavairasi, makoswe adapereka mitundu yambiri ya mavairasi, okhala ndi mitundu yonse ya mavairasi 26, zomwe zikusonyeza kuti ndi malo osungira mitundu yosiyanasiyana ya mavairasi m'derali.
2. Chiwopsezo cha Zoonotic
Kuwunika zoopsa za matenda a zoonotic kunapeza mavairasi atatu odziwika bwino a matenda a zoonotic: kachilombo ka encephalomyocarditis, kachilombo ka Lassa, ndi mitundu ya Rocahepevirus. Kuphatikiza apo, mavairasi atatu—kachilombo ka Melian, kachilombo ka hepatitis ya makoswe, ndi kachilombo ka Hunnivirus A—anapezeka kuti ali ndi chiopsezo chofalikira kwa matenda.
Mwa mavairasi 26 omwe angopezeka kumene, anayi adanenedwa kuti ali ndi mphamvu yayikulu yoberekera ana kutengera mawonekedwe a phylogenetic ndi majini. Chodziwika bwino n'chakuti, Bat ledantevirus 2 idawonetsa ubale wapafupi kwambiri ndi kachilombo ka Le Dantec komwe kamayambitsa matenda mwa anthu.
Kafukufuku wotsatira wa serological adathandizira izi, popeza ma antibodies oletsa matenda a Bat ledantevirus 2 adapezeka mu 2.8% ya sera kuchokera kwa anthu am'deralo. Zotsatirazi zikusonyeza kuti matenda osadziwika kapena osawonetsa zizindikiro mwina adachitika kale mwa anthu, zomwe zikuwonetsa njira yofalitsira matenda a zoonotic koma yomwe sinadziwikepo kale.
3. Mphamvu Yotumizira Ma Transmission a Mitundu Yosiyanasiyana
Kusanthula kwa kufalikira kwa mitundu yosiyanasiyana ya kachilomboka kunasonyeza kuti makoswe ali ndi malo ofunikira kwambiri mkati mwa netiweki yogawana mavairasi, akugwira ntchito ngati mfundo zazikulu zomwe zimathandiza kusinthana kwa mavairasi pakati pa mitundu ya anthu omwe ali nawo. Mavairasi 15 onse adapezeka kuti ali ndi kuthekera kofalitsa mitundu yosiyanasiyana ya kachilomboka.
Kusanthula kwina kwa njira zofalitsira matenda osiyanasiyana kwasonyeza kuti kugawa kwa mavairasi kumachitika kawirikawiri pakati pa anthu okhala ndi kachilombo komweko m'dongosolo lomwelo la taxonomic, zomwe zikusonyeza kuti ubale wa anthu okhala ndi kachilombo umagwira ntchito yofunika kwambiri pakusintha kwa matendawa. Mosiyana ndi zimenezi, mileme inali ndi mphamvu yochepa yofalitsira matenda osiyanasiyana.
Chofunika kwambiri, umboni wa kukula kwa malo okhala ndi kachilomboka unawonedwa m'mavairasi ena. Mwachitsanzo, kachilombo ka Melian, komwe kale kankaonedwa kuti ndi ka shrews, kanapezekanso m'makoswe mu kafukufukuyu, zomwe zikusonyeza kusintha kwa momwe kachilomboka kamasinthira komanso chiopsezo chowonjezeka cha kufalikira kwa kachilomboka.
Mapeto ndi Zotsatira za Thanzi la Anthu Onse
- Kuchuluka kwa mitundu yosiyanasiyana ya zinyama zakuthengo:Kupezeka kwa mavairasi 39 a RNA, kuphatikizapo mitundu 26 yatsopano, kukuwonetsa malo akuluakulu osungira mavairasi m'derali ndipo kukuwonetsa koyamba kuti mavairasi atsopano omwe ali ndi mphamvu yayikulu yowononga tizilombo toyambitsa matenda (monga Bat ledantevirus 2).
- Makoswe monga zolinga zofunika kwambiri zowunikira:Makoswe amagwira ntchito ngati malo ofunikira kwambiri pakufalikira kwa mavairasi ndipo ali ndi mitundu yosiyanasiyana ya mavairasi, zomwe zikuyimira chiopsezo chachikulu cha kufalikira kwa mavairasi.
- Kufunika kwa njira zowunikira zophatikizika:Zomwe zapezekazi zikuthandiza kuyika patsogolo makoswe m'mapulogalamu owunikira mwachangu komanso kukhazikitsa njira zophatikiza metagenomics, serology, ndi kuwunika zachilengedwe pamalo olumikizirana pakati pa anthu ndi nyama zakuthengo.
Ponseponse, kafukufukuyu akupereka umboni wofunikira wochirikiza njira zochenjeza msanga komanso njira zowunikira zoopsa za matenda opatsirana ndi nyama, zomwe zikulimbitsa kufunika koyang'anira mwachangu m'madera omwe ali pachiwopsezo chachikulu.
Zambiri Zamalonda
Nthawi yotumizira: Mar-23-2026